19. yy. da Edirne Vilayeti Kırkkilise (Kırklareli) sancağına bağlı bir kaza idi. Babaeski 1912 yılında Bulgarların , 1919da da Yunanlıların işgaline uğramıştır. Kurtuluş Savaşı sırasında Türk askeri kuvvetlerinin toplanma yerlerinden olan Babaeskide Trakya Paşaeli Müdafa-i Hukuk Cemiyeti kurulmuştur. Kurtuluş Savaşı sırasında 9 Kasım 1922de işgalden kurtarılmıştır. Cumhuriyetin ilanından sonra 1924te Kırklareli iline bağlı ilçe konumuna getirilmiştir
