Otoimmün tiroid bezi hastalıklarının tanısında kullanılan bir testdir.Hashimato hastalığında anti peroksidaz testi pozitif yani yüksek çıkmaktadır.Hashimoto tiroiditi olarak da bilinen bu otoimmün hastalıkta, tiroid bezinde tiroid hormonlarının yapımındaki basamaklarda kullanılan protein yapısındaki Tiroid peroksidaz (TPO) yabancı bir doku olarak algılanmaktadır. Bağışıklık sistemi bu nedenle TPOya karşı antikor oluşturur.Bu nedenle de anti peroksidaz testi yüksek yani pozitif çıkar. Bu hastalarda hipotiroidi belirtileri bulunmaktadır.